Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNPO2Q9UMS6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms