Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms