Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA1Q9UJY5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms