Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA4Q9UI42 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA4Q9UI42 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA4Q9UI42 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms