Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAPAQ9P0L0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAPAQ9P0L0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms