Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA3Q9NZ52 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GGA3Q9NZ52 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms