Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms