Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMSN1Q9NSI8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms