Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRMQ9NS64 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms