Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPOLBQ9NRJ5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms