Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMYD2Q9NRG4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMYD2Q9NRG4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms