Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE4Q9NR33 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms