Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDH12Q9NPG4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms