Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACKR4Q9NPB9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR4Q9NPB9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR4Q9NPB9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACKR4Q9NPB9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms