Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CABP2Q9NPB3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP2Q9NPB3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms