Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR6Q9HBX8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR6Q9HBX8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms