Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRPEL1Q9HAV7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRPEL1Q9HAV7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms