Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMYD3Q9H7B4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMYD3Q9H7B4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms