Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf49Q9H6J7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf49Q9H6J7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms