Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK3Q9H422 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIPK3Q9H422 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms