Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM3Q9BZL3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms