Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD3Q9BZ95 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NSD3Q9BZ95 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms