Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms