Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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