Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDHR2Q9BYE9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms