Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms