Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG6Q9BXT2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG6Q9BXT2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms