Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms