Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf16Q9BUW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms