Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT17Q9BSW7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT17Q9BSW7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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