Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms