Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA3Q9BQP9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA3Q9BQP9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms