Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP2Q99959 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKP2Q99959 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms