Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT140Q96RY7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT140Q96RY7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms