Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD27Q96NW4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms