Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH12Q96NR8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms