Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms