Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD1Q96JS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms