Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCHS1Q96JQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms