Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms