Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC10A4Q96EP9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms