Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF183Q96D59 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF183Q96D59 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms