Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF3Q92576 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms