Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms