Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIRE2Q8WWL2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms