Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL8

TMEM116, Transmembrane protein 116, humanhuman

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116Q8NCL8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM116Q8NCL8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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