Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRBD1Q8N5C6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRBD1Q8N5C6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms