Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8N3U1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8N3U1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8N3U1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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