Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms