Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNRD3Q86VQ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNRD3Q86VQ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNRD3Q86VQ6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNRD3Q86VQ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNRD3Q86VQ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNRD3Q86VQ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms